مرکز جامع درمواردی با دیگر مراکز و موسسات حوزوی وجوه مشترکی دارد که باید در راستای سیاست های کلی مرکز مدیریت حوزه های علمیه قم و مصوبات شورای عالی حوزه آنها را اجرا نماید و در مقابل وجه امتیاز این مرکز در کیفیت و نظارت دقیق بر اجرای برنامه های آموزشی میباشد.
یکی از مسائل مهمی که می خواهیم تا طلاب آن را مدنظر قرار دهند اینکه مرکز جامعه را از خودشان بدانند و امور را بر طبق رفاقت و برادری پیش ببرند.<br> نه بر طبق مسئول و زیردست؛ بلکه بر اساس محبت و احترام و رفاقت.
معاونت تهذیب و فرهنگی مجتمع عالی ولی امر{عج} برای اینکه بتواند اهدافی را که در زمینه های تهذیبی اخلاقی و فرهنگی دارد را با یک فرآیند و نقشه راهی پیش ببرد، ابتداءً تلاش کرده است تا برنامه ای را برای این مسیر بنویسد و به تصویب مسولین محترم مرکز برساند.
در تبلیغ بین الملل ظرفیت خوبی از طلاب آشنا به زبان خارجی در مرکز وجود دارد که می توانیم تبلیغ بین الملل را هم راه اندازی کنیم همینطور در زمینه تبلیغات تخصصی یکی از اهداف و برنامه های ماست
مرکز جامع علوم اسلامی ولی امر عجل الله تعالی فرجه الشریف جهت تامین نیروی های کارآمد و روزآمد حوزوی برای تولید علم دینی مورد نیاز جامعه اسلامی و همچنین تربیت نیروهای مورد نیاز حکومت اسلامی، در سال 1387 تاسیس شد و هم اکنون 195 طلبه دارد.